南京軍區(qū)福州總醫(yī)院兒科是全軍兒科疾病診治中心、全軍計劃生育優(yōu)生優(yōu)育研究所骨干研究室之一。中心擁有福建省新生兒救護網(wǎng)絡(luò)福州新生兒救護分中心和兒童腎臟病中心兩個兒童?？浦行摹，F(xiàn)有專業(yè)技術(shù)人員75名，其中專業(yè)技術(shù)高級職務(wù)11名、中級職務(wù)5名；博士后1名、博士4名、碩士7名。中心展開病床90張，分設(shè)兒童病房、兒童重癥監(jiān)護室(PICU)、新生兒病房和新生兒重癥監(jiān)護室(NICU)四個病區(qū)。中心設(shè)有兒科研究室、檢查室和資料室；配備有呼吸機、床邊血液凈化機、過敏原檢測儀、遠紅外線搶救臺、電子保暖箱、藍光治療箱等醫(yī)療設(shè)備及自動照相顯微鏡、PCR儀等實驗設(shè)備。

中心在兒童腎臟、兒童心血管、兒童消化、兒童神經(jīng)、新生兒、兒童急救和兒童保健方面優(yōu)勢突出，每年收治住院患兒3500名左右，其中不少是從省內(nèi)外醫(yī)院轉(zhuǎn)診來的危重、疑難患兒。近年來，中心在國家或地區(qū)發(fā)生重大公共衛(wèi)生突發(fā)事件（如手足口病爆發(fā)流行、三聚氰胺毒奶粉事件、甲型H1N1流感病毒爆發(fā)流行和兒童群體性蓖麻子中毒）時發(fā)揮了重要作用，及時地控制了疾病流行和挽救了患兒生命，為軍事兒科學做出了貢獻。

中心是兒科學博士研究生和碩士研究生聯(lián)合培養(yǎng)點、福建省兒科住院醫(yī)師規(guī)范化培訓基地?，F(xiàn)有博士研究生導師1名、碩士研究生導師4名。近5年來，年培養(yǎng)研究生4～6名。

中心近5年獲得國家自然科學基金、國家科技支撐計劃課題子課題、福建省自然科學基金、南京軍區(qū)創(chuàng)新課題等6項省部級以上課題資助；先后在SCI收錄期刊發(fā)表論文8篇，核心期刊發(fā)表論文120多篇；榮獲軍隊、省部級以上科技獎二等獎3項、三等獎6項。

中心在全國、全軍享有較高群體學術(shù)地位?，F(xiàn)有三人擔任《中華兒科雜志》編委。一個綜合性醫(yī)院兒科，三人同時擔任《中華兒科雜志》編委，在國內(nèi)同級醫(yī)院兒科是唯一的；四人分別擔任中華醫(yī)學會兒科學分會心血管學組、消化學組、臨床藥理學組和腎臟學組委員，這在國內(nèi)綜合性醫(yī)院兒科也是唯一的。中心是南京軍區(qū)兒科學專業(yè)委員會主任委員單位，現(xiàn)有全軍兒科學專業(yè)委員會顧問1名、常委1名，全軍兒科專業(yè)委員會學組顧問3名、副組長3名、學組委員4名，福建省兒科學會副主任委員1名。