器官移植是醫(yī)院的主要特色，已先后開展腎臟、肝臟、肝-胰-腎、肝-腎、胰-腎、心臟、心肺、肺臟、角膜、骨髓、胰島細(xì)胞、干細(xì)胞等移植，手術(shù)的種類、數(shù)量和質(zhì)量居國內(nèi)領(lǐng)先水平，成為國內(nèi)重要的大型器官移植中心之一。同時(shí)，醫(yī)院在腎臟病、肝膽疾病、女性尿失禁、脊柱疾病、顱腦疾病、老年病、心腦血管病、消化病、腫瘤等疾病診治方面處于國內(nèi)先進(jìn)水平。醫(yī)院開展的臨床檢驗(yàn)技術(shù)、血液凈化技術(shù)、放射介入技術(shù)、病理診斷技術(shù)、微創(chuàng)技術(shù)、超聲診治技術(shù)等處于軍內(nèi)外、省內(nèi)外先進(jìn)水平。

醫(yī)院設(shè)有國家人事部博士后科研工作站，擁有7個(gè)博士后帶教學(xué)科。醫(yī)院是廈門大學(xué)附屬東方醫(yī)院，第二軍醫(yī)大學(xué)、南方醫(yī)科大學(xué)、福建醫(yī)科大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院，第四軍醫(yī)大學(xué)、安徽醫(yī)科大學(xué)、南昌大學(xué)醫(yī)學(xué)院教學(xué)醫(yī)院。有40個(gè)學(xué)科（專業(yè)）點(diǎn)與上述高校及福建中醫(yī)學(xué)院等聯(lián)合培養(yǎng)博士、碩士研究生，擁有博士、碩士研究生導(dǎo)師124名。此外，醫(yī)院每年還承擔(dān)上述高校及其它高校近600名本科生臨床大課、臨床見習(xí)、臨床實(shí)習(xí)教學(xué)任務(wù)，每年接收軍內(nèi)外進(jìn)修生200余人次。